知乎用户，生命潦草，我在弯腰
把这个问题拆成很多小问题来看：
1.正常人（指未患细菌、真菌等感染性疾病的人）体内是否有细菌？
有！不仅有，还种类繁多，数量巨大，一个正常成年人身上的细菌，比整个地球的人类数量还多。
不仅人体内有大量细菌存在，在周围的环境中，也有非常多的细菌，可以说，人体和环境中的细菌 / 真菌，是不可能完全消灭的。
2.这些细菌有怎样的作用？
细菌对人类而言并不全是“坏的”，人体中的细菌可以辅助消化，提供营养物质，甚至近年来有很多研究表明，体内菌群对人体免疫、肥胖甚至寿命均有影响。人体内不同部位细菌的种群和数量都维持在相对平衡的状态，打破这个平衡，就会发生危险。
3.为什么会有细菌感染，人体正常带有的细菌为什么不感染人类？
（1）人类的免疫力正常的时候，可以和这些细菌维持相对平衡，比如少量细菌进入血液循环，能被白细胞消灭，而不会造成感染；
（2）当人类免疫力下降的时候，或者某些屏障被破坏的时候，细菌就有可能移位，并且大量繁殖，免疫系统不能抑制细菌，细菌分泌的内外毒素损伤机体，出现一系列综合征。
对于大多数细菌而言，人体能否控制住他们，最主要取决于人体的免疫力。
4.抗菌药物在治疗细菌感染中起到怎样的作用？
抗菌药物是针对特定种类的细菌 / 真菌 / 其他感染病原体，大多数抗菌药物并不能覆盖所有的病原体，而几乎所有的抗菌药都不同程度地有耐药情况。
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换句话说，能消灭所有细菌的抗菌药=不存在。
所以，在细菌感染性疾病中，抗菌药物能够将感染细菌数量减少，重新达到能被患者免疫力控制住的水平，以建立新的平衡。
5.为何说大多数情况下抗菌药物不能起到预防细菌感染的作用？
（1）抗菌药物不能消灭所有的细菌，只能减少某些特定种类细菌的数量。
（2）打破生态平衡后，某些对该种抗菌药物耐药的细菌将快速繁殖，细菌生态平衡被破坏，患者由原某些细菌维持的生理功能受到影响，其中包括免疫功能。
（3）患者免疫功能下降，更容易受到细菌的攻击。其他消化、营养也受到影响，患者一般状况变差，更难以恢复。
6.哪些情况下可以用抗菌药物预防感染？
某些免疫力低下的患者在进行侵入操作（如手术）的时候，因为手术本身可以造成细菌从有菌部位（如表皮、肠道）侵入无菌部位（如中枢系统、循环系统等）导致感染，因此对于这部分患者而言，可能需要使用抗菌药物减少这些有菌部位的细菌，预防感染。但对于抗菌药物的种类、使用时机、疗程都有严格的要求，非医学人员不易掌握。
其他一些情况，可以参考《抗菌药物临床应用指导原则 2015 版》，但那个主要也是供专业人员阅读的。
综上所述，抗菌药物是处方药，需要凭医生处方调配，自行使用，风险较大。